הוועד הפראלימפי הלאומי של אוקראינה העלה ארבע האשמות ספציפיות נגד הוועד האולימפי העולמי ומארגני משחקי מילאנו-קורטינה, תוך גינוי היחס הבלתי הולם כלפי ספורטאיו וניסיון "שיטתי" להסיר דגלים מהמתחרים וגם מהיציעים.
המשלחת האוקראינית טוענת כי המארגנים כפו את הדרת דגל אוקראינה מתוך הכפר הפראלימפי. האוקראינים גם טוענים כי מדליסטית הזהב בביאתלון פראלימפי, אולכסנדרה קונונובה, נדרשה להסיר עגילים שעליהם הופיע דגל אוקראינה והמסר "Stop War" ("עצרו את המלחמה") כאשר התכוננה לעלות לפודיום קבלת המדליות.
"כל האנשים בעולם היום רוצים לעצור את המלחמה", אמר ולרי סושקביץ', נשיא הוועד הפראלימפי הלאומי של אוקראינה ל-The Athletic. "האישה הזו, אלופה פראלימפית, היא אם לשתי בנות. היא רוצה לעצור את המלחמה", הוסיף, וכינה את החלטות ה-IPC "נוראיות".
תלונה נוספת מיוחסת למשפחתו של גולש הסקי למרחקים טאראס ראד, לה הוחרמו דגלי אוקראינה. "הוועד הפראלימפי הלאומי של אוקראינה והנבחרת הפראלימפית הלאומית של אוקראינה, ספורטאיה ומאמניה, היו נתונים ללחץ שיטתי מצד נציגי הוועד הפראלימפי הבינלאומי ומצד הוועדה המארגנת של המשחקים. יש ביטויים מערכתיים וחסרי תקדים של לחץ מצד נציגי ה-IPC על הנבחרת האוקראינית. ברור כי נוצרת תחושה של שותפות בלתי מובנת ומיוחדת מאוד של ה-IPC עם הוועדים הפראלימפיים הלאומיים של רוסיה ובלארוס".
בתגובה מסרה הוועדה המארגנת של מילאנו-קורטינה כי הדגל בכפר האולימפי הוסר משום שהיה ממוקם באזור משותף, וכי הדגל של משפחת ראד כלל טקסט שמשמעותו "לא יכלה להיות מאומתת על ידי אבטחת האולם". הוועדה הוסיפה כי היא מחויבת להמשיך לספק סביבה מכבדת ומזמינה לכל המשתתפים, כולל ספורטאים וצופים.
בנוגע לקונונובה, דובר מטעם הנהלת ה-IPC מסר: "אחד מאנשי הצוות שוחח עם הספורטאית, אמר לה שהעגילים ככל הנראה היו מנוגדים לכללים שלנו ושאל: 'האם תוכלי להסיר אותם?'. הספורטאית הסכימה. לכן, מבחינתנו העניין סגור. אנו מביעים אמפתיה עמוקה למצב שעמו מתמודד העם האוקראיני ברגע זה, אך לא משנה בכמה משחקים השתתפה המדינה, אין בכך כדי לתת לה אור ירוק להפר את הכללים. לקראת המשחקים הללו הבהרנו לכל המדינות המשתתפות את הכללים הנוספים הנוגעים להפגנות"
שישה ספורטאים רוסים וכן ארבעה ספורטאים מבלארוס, משתתפים במשחקים הללו משום שקיבלו הזמנות "ביפרטיטיות" - סוג של העפלה אוטומטית - שאושרו רשמית פחות משבועיים לפני פתיחת המשחקים הפראלימפיים, עבור ספורטאים מסוימים ברמה גבוהה.