יוני סטויאנוב האריך את חוזהו בהפועל באר שבע עד לתום עונת 2028/2029. לאחרונה סטויאנוב החל להשתלב באימוני הקבוצה, זאת לקראת חזרתו למגרשים לאחר ניתוח שעבר ברצועה הצולבת בעקבות פציעה שספג בסוף העונה שעברה. לאחר חתימתו אמר: "אני מודה מקרב לב להנהלת המועדון ולצוות המקצועי על האמון בי. אני נמצא כעת בשלבים הסופיים של החזרה מהפציעה שעברתי, וזו הזדמנות טובה להודות לצוות הרפואי והפיסיולוגי של המועדון על הליווי הצמוד והטיפול המסור. מחכה בקוצר רוח לחזור לטרנר ולפגוש את הקהל".
הפציעה קרתה באפריל שנה שעברה, ויומיים אחרי שהתקבלו תוצאות הבדיקות וסטויאנוב הבין שלפניו שיקום ארוך ומורכב, הוא שיתף את עוקביו ברשתות החברתיות: "עברו עליי ימים לא פשוטים מאז הפציעה - גם פיזית וגם נפשית, אבל התמיכה מהמשפחה, מהצוות המקצועי, מהחברים לקבוצה, מהקהל והסובבים סביבי חיממה לי את הלב ומעניקה לי כוח גדול".
"אני נחוש ומלא מוטיבציה לקראת השיקום ובטוח שאחזור חזק יותר משהייתי", המשיך סטויאנוב, "רק מחכה לרגע שאוכל לחזור לדרוך בטרנר. תודה לכולם".
סטויאנוב רשם בעונה שעברה 27 הופעות בליגת העל ובמהלכן כבש פעמיים והוסיף בישול אחד. בפברואר אשתקד האריך את חוזהו בקבוצה עד 2028.