שגרת האימונים של ספורטאי וספורטאיות הנבחרות האולימפיות, נמשכה במתכונת מצומצמת גם במהלך ימי הלחימה, תוך הקפדה על הנחיות פיקוד העורף. בימי המלחמה התאמנו ענפי הג'ודו, התעמלות מכשירים, התעמלות אמנותית, שחייה, שחייה אמנותית, כדורמים, טריאתלון, טניס שולחן, כדורעף אולמות וכדורעף חופים.
במסגרת המתווה התאפשר אימון של עשרות ספורטאים. רוב הנבחרות שהתאמנו במכון בימים אלו נערכות לאליפויות עולם ואליפויות אירופה. בעבור חלק מהנבחרות האימונים במכון היו תחליף למחנות אימונים בחו"ל, שהתבטלו בשל מצב החירום. כך למשל נבחרת השחייה והשחייה האמנותית, שצפויות להתמודד ביולי באליפות עולם בוגרים.
מנכ"ל מכון וינגייט גיא אטיאס: "לאורך ימי המלחמה ראינו חשיבות רבה, למצוא את הפתרונות שיאפשרו לנבחרות להגיע ברמת מוכנות מיטבית להתמודדויות הצפויות להם באליפויות עולם ואירופה ותחרויות בינלאומיות שונות. תודתי העמוקה לשר התרבות והספורט מיקי זוהר שיזם את המתווה, ליו"ר המכון ד"ר יואב הלר על התמיכה והגיבוי ולמנהלי ועובדי מכון וינגייט שביצעו את המלאכה במסירות ובתחושת שליחות בימים מורכבים. אין לנו ספק שהרוח הישראלית שבאה לידי ביטוי בקרבות של לוחמינו וטייסנו, תוכיח את עצמה גם בהתמודדויות הספורטיביות, בענפים השונים".