אחרי 124 הופעות בין הקורות של שכללו את הזכייה במונדיאל 2014, מנואל נוייר פרש היום (רביעי) מהמדים הלאומיים של נבחרת גרמניה. השוער בן ה-38 הצטרף לתומאס מולר, אילקאי גונדואן וטוני קרוס, שגם פרש מכדורגל הקיץ, והשאיר את אפודת השוער הראשון, אולי, למארק אנדרה טר סטגן.
לאחר הפרישה מהנבחרת כתב נוייר בחשבון האינסטגרם שלו: "הגשמנו יחד חלומות גדולים והפכנו לאלופי העולם בברזיל. היה לי הכבוד להוביל את נבחרת גרמניה כקפטן. טורניר היורו הביתי היה השיא, גם אם לא השגנו את הגביע. כל שנייה הרגישה לי מיוחדת. תודה לכל הצוות המקצועי, המאמנים והשחקנים שליוו ותמכו בי מאז הבכורה ב-2009. תודה לאוהדים, אהבתי ללבוש כל רגע את מדי הנבחרת".
את הבכורה שלו ערך ביוני 2009 בגיל 23, ומאז הספיק להשתתף בארבעה מונדיאלים וארבעה טורנירי יורו, כשהשיא כאמור היה הנפת גביע העולם ב-2014.