יונתן כהן היה בדובאי במהלך פגרת החורף והתכונן לחזרת הליגה האיטלקית השנייה בשבת הקרובה (15 בינואר), אולם לצערו הוא לא יהיה חלק מסגל הקבוצה במשחק הבית מול פרוזינונה. הישראלי בן ה-25 נמצא חיובי לקורונה ועל כן נכנס לבידוד ולא יוכל לסייע לקבוצתו מול המדורגת שמינית, אם המשחק אכן יתקיים כי פיזה סובלת מהתפרצות קורונה ונכון לכתיבת שורות אלה נדבקו מתחילת החודש 14 משחקניה.
יש לציין שכהן מרגיש טוב ואינו סובל מתסמינים בשלב זה, אולם יעמוד לרשות פיזה בפעם הבאה רק בשבת ה-22 בינואר במשחק החוץ נגד ספאל. הליגה האיטלקית השנייה יצאה לפגרה ב-18 בדצמבר, אז הישראלי כבש את שערו השלישי העונה בניצחון 0:2 על קונצזה שהבטיח לפיזה יתרון של ארבע נקודות בפסגה.
כשהקורונה התפרצה במכבי תל אביב לפני משחקי פלייאוף ליגת האלופות נגד זלצבורג בספטמבר 2020, יונתן כהן היה בין השחקנים שנמצאו חיוביים לנגיף ובזמנו אף סיפר כי סבל מתסמינים לא פשוטים במשך שלושה ימים.