שנתיים לאחר שעזב, חוזר ננו גינזבורג לנימבורק הצ'כית. המאמן הישראלי סגר בקבוצה לשתי העונות הבאות, כשבמקביל ימשיך לאמן את נבחרת צ'כיה, אותה יוביל ביורובאסקט הקרוב. את הנבחרת שלו יעטרו שחקנים כמו תומאש סטורנסקי מברצלונה, דויד ילינק ששיחק בעבר בקאחה לבוראל, ייז'י וולש הוותיק מנימבורק, לובוש ברסון מפואנלברדה וכמובן שיאן וסלי המצוין מפנרבחצ'ה/אולקר.
גינזבורג בן ה-52 החל את קריירת האימון שלו במחלקת הנוער ברמת השרון ובמקביל שימש כעוזר מאמן בבני הרצליה. בדצמבר 2000 החליף את חנוך מינץ כמאמן בני הרצליה. בעונה לאחר מכן לקח את רמת השרון מהליגה הלאומית והעלה אותה לליגת העל, ורשם שנתיים טובות עם הקבוצה בליגה הראשונה. בעונת 2004/5 מונה למאמן בני השרון, ובעונה שלאחר מכן אימן בגבעת שמואל.
בעונת 2006/7 יצא לראשונה לצ'כיה כעוזרו של מולי קצורין, ושימש בתפקיד 4 שנים. בעונת 2010/11 החליט קצורין לעזוב לאיגוד הכדורסל וגינזבורג קיבל את התפקיד וביצע אותו בהצלחה יתרה, כשמלבד שלוש זכיות בדאבל הצ'כי הוביל את הקבוצה כמעט לכניסה ליורוליג, לרבע גמר היורוקאפ ולניצחונות מרשימים בליגת ה-VTB על צסק"א מוסקבה וחימקי מוסקבה.